Ancienne porte-parole des Sans-Papiers, notamment lors de l'occupation de l'église de St-Bernard (Paris), elle est la présidente de l'ONG REFDAF, organisée sous la forme d'un réseau regroupe plus de 150 associations de base et de fédérations d'associations de la sous-région ouest-africaine.
Madjiguène Cissé a été nommée Présidente 2011 (Dakar, Sénégal).